Бакугани живуть в галактиці під назвою Вестроя. У давні часи Вестроя розділилася на 6 світів: світ Води (Аквоса), світ Вітру (Вентуса), світ Землі (Сабтерры), світ Світла (Хаосу), світ Темряви (Даркуса) і світ Вогню (Пайруса) — все бакуганы, що раніше були єдиними, відповідно розділилися на 6 стихій. У результаті поділу Центр Вестроі також розділився на дві частини: Зону Нескінченності, містить в собі позитивну енергію, і Зону Безмовності, містить в собі негативну енергію. Також в момент поділу Вестройи народилися два нових бакугана, не мають своєї стихії, а відповідно, особливої сили, білі або забуті бакугани — Нага і Вейв. Нага, плекає думки про могутність, вирішив захопити Зони Нескінченності і Безмовності. Але Зона Безмовності втягла його в себе, а Зона Нескінченності увійшла в його сестру Вейв. Все це викликало новий катаклізм в Вестройе, завдяки якому бакугани потрапили на Землю. Там всі вони були згорнуті в невеликі кульки, які вміщалися в руці. Люди підібрали «впали з неба» бакуганов і придумали з ними гру. Те ж саме свого часу сталося і на Вестрое. Після того, як Драгоноид здійснив Чарівний Переворот і відновив цілісність Вестроі, з'єднавши всі шість світів в один, поділ бакуганов на стихії тим не менш залишилося.

У 3 сезоні бакуганов навчилися клонувати у віртуальній реальності «Бакуган ИнтерСпейс». У Нифии і Гандэлии бакугани з'явилися по-іншому. Творець бакуганов — Код життя, який насправді є Священною Сферою Нифии. Всі бакугани з однієї планети. І коли світ бакуганов розділився на світи, підвладні стихіям, половина бакуганов вирушила в іншу точку Всесвіту (в Гандэлию і Нифию). У Гандэлии залишилася велика частина 6 бакуганов стихій, а у нифианцев залишилися бакугани Хаосу (інших стихій бакуганов було мало).